Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01787 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01787 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01787 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01787 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01787 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01787 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01787 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01787 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01787 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01787 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01787 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms