Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01727 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01727 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01727 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01727 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01727 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01727 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01727 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01727 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01727 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01727 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms