Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01662 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01662 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01662 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01662 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01662 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01662 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01662 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01662 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms