Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01661 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01661 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01661 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01661 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01661 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01661 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01661 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01661 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms