Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01649 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01649 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01649 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01649 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01649 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01649 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01649 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01649 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01649 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms