Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igk-V19-17P01633 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms