Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4bP01029 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4bP01029 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4bP01029 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4bP01029 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4bP01029 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4bP01029 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4bP01029 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4bP01029 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4bP01029 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4bP01029 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4bP01029 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4bP01029 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4bP01029 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4bP01029 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4bP01029 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4bP01029 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4bP01029 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4bP01029 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4bP01029 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4bP01029 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4bP01029 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4bP01029 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4bP01029 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4bP01029 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4bP01029 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4bP01029 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4bP01029 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C4bP01029 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4bP01029 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms