Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abl1P00520 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abl1P00520 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms