Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Robo1O89026 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Robo1O89026 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Robo1O89026 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Robo1O89026 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Robo1O89026 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms