Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BlmO88700 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BlmO88700 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BlmO88700 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BlmO88700 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BlmO88700 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BlmO88700 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BlmO88700 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BlmO88700 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BlmO88700 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BlmO88700 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BlmO88700 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BlmO88700 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BlmO88700 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BlmO88700 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BlmO88700 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BlmO88700 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BlmO88700 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BlmO88700 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BlmO88700 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BlmO88700 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BlmO88700 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
BlmO88700 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BlmO88700 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BlmO88700 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BlmO88700 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BlmO88700 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BlmO88700 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BlmO88700 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BlmO88700 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BlmO88700 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms