Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pak1O88643 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms