Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20bO88575 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a20bO88575 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms