Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfrO88507 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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