Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsd1O88491 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsd1O88491 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms