Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfdp1O88271 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfdp1O88271 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms