Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CaskO70589 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CaskO70589 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CaskO70589 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CaskO70589 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CaskO70589 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CaskO70589 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CaskO70589 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CaskO70589 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CaskO70589 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CaskO70589 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms