Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1bO70237 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfi1bO70237 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms