Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AurkbO70126 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkbO70126 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkbO70126 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AurkbO70126 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkbO70126 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkbO70126 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkbO70126 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms