Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad51dO55230 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad51dO55230 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad51dO55230 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms