Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Supt5hO55201 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms