Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx4O55187 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx4O55187 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms