Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2a2O55143 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2a2O55143 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms