Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap1O55125 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap1O55125 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms