Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg2O55111 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms