Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrxO55103 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PrxO55103 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrxO55103 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrxO55103 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrxO55103 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrxO55103 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrxO55103 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PrxO55103 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PrxO55103 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrxO55103 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrxO55103 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrxO55103 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrxO55103 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrxO55103 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrxO55103 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PrxO55103 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrxO55103 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrxO55103 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PrxO55103 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms