Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngr1O55100 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr1O55100 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms