Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck2O55033 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck2O55033 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck2O55033 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms