Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb2O55029 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb2O55029 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms