Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdh16O54909 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms