Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms