Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp10aO54827 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp10aO54827 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms