Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brs3O54798 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms