Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp100O35892 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms