Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms