Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kpna4O35343 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna4O35343 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna4O35343 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms