Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pkd2O35245 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkd2O35245 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2O35245 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms