Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe40O35185 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe40O35185 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms