Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Polr1aO35134 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms