Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Q1O19441 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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H2-Q1O19441 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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H2-Q1O19441 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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H2-Q1O19441 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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