Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap23O09044 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap23O09044 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap23O09044 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap23O09044 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms