Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp2O08999 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ltbp2O08999 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp2O08999 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms