Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NumblO08919 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NumblO08919 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NumblO08919 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NumblO08919 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NumblO08919 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NumblO08919 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NumblO08919 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NumblO08919 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NumblO08919 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NumblO08919 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms