Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eftud2O08810 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Eftud2O08810 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eftud2O08810 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms