Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dctn1O08788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn1O08788 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms