Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp12O08736 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casp12O08736 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casp12O08736 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms