Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MsmbO08540 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MsmbO08540 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsmbO08540 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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