Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm3488M0QW81 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms