Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6871L7N248 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6871L7N248 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6871L7N248 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm6871L7N248 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm6871L7N248 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm6871L7N248 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6871L7N248 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6871L7N248 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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