Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r80L7N1Z3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r80L7N1Z3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms