Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm2056J3QQ02 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2056J3QQ02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms